En Janvier 1963, il subit une révision. Il fait ensuite escales à Seattle et Vancouver.

Il rejoint ensuite sa nouvelle affectation à Pearl Harbor (Hawaii). Il fait partie de SUBDIV 13.

Il opère localement de Février à Avril 1963.

Il se dirige ensuite vers l'Australie pour commémorer la Bataille de la Mer de Corail en faisant escale à Brisbane, Melbourne et Perth.

Il va ensuite à Subic Bay aux Philippines pour participer à des exercices avec la 7ème Flotte. Il fait escale également au Japon, Naha (Okinawa), Sasebo, Kobe, et Yokosuka.

Il retourne à Pearl Harbor où il arrive le 26 Octobre 1963.

En 1964, il reste dans les eaux hawaiiennes. À la fin de l'année, il passe deux fois à Wake Island pour essais du Système SUBROC. Deux fois, il sert de bateau cible...

En Février 1965, il commence son deuxième déploiement en Extrême-Orient. Il fait escale à  Hong Kong, Subic Bay, et Yokosuka.

Il sert également de soutien à certaines opérations au Vietnam.

En Juin, il retourne à Pearl Harbor, puis effectue des opérations locales jusqu'à début Septembre 1965. Il rentre ensuite une nouvelle fois à une révision.

Son indisponibilité se termine le 26 Septembre 1966. Il effectue alors des essais de son système d'armes et d'écoute dans le Puget Sound.

Il participe à un projet de recherche et de développement près de Nanoose (Canada). Après avoir fait escale à Vancouver, il fait route de nouveau vers Pearl Harbor où il arrive début Novembre 1966.

Après trois mois de préparation et de formation, le "Blueback" part pour le Pacifique occidental, le 17 Février 1967. La mission dure sept mois avec formation à la mer de l'équipage et appuis des troupes américaines au Vietnam. Il fait escale Hong Kong, Yokosuka et Sasebo.

Il arrive à Pearl Harbor le 20 Septembre 1967. Après un mois d'entretien, il effectue des opérations locales. Le 19 Décembre 1967, Il entre en indisponibilité au Chantier Naval de Pearl Harbor.